上海临港新片区海洋生物医药科技创新型平台专家团队——徐晓雁

发布日期:2023-11-06

浏览次数:22

研究方向:鱼类非编码RNA调控机制分析;鱼类比较基因组和重要经济性状基因的定位。

上海海洋大学水产与生命学院副研究员及硕士生导师。2015年毕业于上海海洋大学水产养殖专业,获得农学博士学位。随后的20167月至20176月在美国奥本大学进行博士后研究,于20177月正式加入上海海洋大学水产与生命学院,致力于鱼类种质资源与种苗工程及相关领域的教学与研究工作。

01 主要学术成就

· 专注于草鱼抗细菌病的遗传机制解析和全基因组选择育种。

· 基于高密度草鱼遗传图谱,成功将雌性草鱼的基因组拼接至染色体级别,并完成了雄性草鱼的无缺口参考基因组图谱。

· 通过比较基因组学分析,鉴定出草鱼特异性基因家族,揭示了它们在获得性免疫方面的功能。

· 开发了21k草鱼液相芯片,为遗传结构分析、种质评价和基因组关联分析提供了重要工具,利用全基因组关联分析成功获得了9个抗病和5个生长相关位点。

· 通过多种构建荧光标记嗜水气单胞菌,揭示其主要感染途径,为草鱼的抗病机制解析提供了数据支持。

02 近期主要科研项目


1. 主持国家自然科学基金青年基金“草鱼miR-142a-3p同步化调控葡萄糖摄入和炎症反应抑制嗜水气单胞菌感染”。

2. 参与大宗淡水鱼产业技术体系项目“青鱼种质资源与育种”。

03 近期发表论文、著作

论文:

1. H. Niu et al., Clustering pattern and evolution characteristic of microRNAs in grass carp (Ctenopharyngodon idella). BMC genomics 24, 73 (2023).

2. Y. Hao et al., Genome-wide association study reveals growth-related SNPs and candidate genes in grass carp (Ctenopharyngodon idella). Aquaculture 577,  (2023).

3. Y. Liu et al., The effects of exposure to microplastics on grass carp (Ctenopharyngodon idella) at the physiological, biochemical, and transcriptomic levels. Chemosphere 286, 131831 (2022).

4. 亚洲草鱼群体的差异甲基化分析. 水产学报,  (2022).

5. Y. He et al., Transcriptomic analysis to elucidate the effects of high stocking density on grass carp (Ctenopharyngodon idella). BMC genomics 22, 620 (2021).

著作:

1. 参编《草鱼种质资源研究》科学出版社201912

04 授权专利

1. 李家乐,张猛,沈玉帮,傅建军,孙俊龙,徐晓雁,党云飞“一种分子辅助选育草鱼优良品系及选育效果验证的方法”. 专利号:201410667437.0. 发明专利。

2. 李家乐,党云飞,张猛,李立森,徐晓雁,沈玉帮,吕利群. “一种便于河道网箱养殖鱼类、贝类的装置”.专利号:201610874257.9. 发明专利

05 主要荣誉、奖项

2023年,入选《水产学报》青年编委,荣获2023年度中国农业期刊优秀审稿专家称号

2019年,荣获上海市“青年东方学者”称号

2019年,获神农中华农业科技一等奖(排名第11

2019年,获中国水产学会范蠡科技进步一等奖(排名第11

2019年,获神农中华农业科技奖优秀创新团队(排名第7

2019年,获上海市科技进步奖二等奖(排名第4





上海临港新片区海洋生物医药科技创新型平台专家团队——徐晓雁

发布日期:2023-11-06

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研究方向:鱼类非编码RNA调控机制分析;鱼类比较基因组和重要经济性状基因的定位。

上海海洋大学水产与生命学院副研究员及硕士生导师。2015年毕业于上海海洋大学水产养殖专业,获得农学博士学位。随后的20167月至20176月在美国奥本大学进行博士后研究,于20177月正式加入上海海洋大学水产与生命学院,致力于鱼类种质资源与种苗工程及相关领域的教学与研究工作。

01 主要学术成就

· 专注于草鱼抗细菌病的遗传机制解析和全基因组选择育种。

· 基于高密度草鱼遗传图谱,成功将雌性草鱼的基因组拼接至染色体级别,并完成了雄性草鱼的无缺口参考基因组图谱。

· 通过比较基因组学分析,鉴定出草鱼特异性基因家族,揭示了它们在获得性免疫方面的功能。

· 开发了21k草鱼液相芯片,为遗传结构分析、种质评价和基因组关联分析提供了重要工具,利用全基因组关联分析成功获得了9个抗病和5个生长相关位点。

· 通过多种构建荧光标记嗜水气单胞菌,揭示其主要感染途径,为草鱼的抗病机制解析提供了数据支持。

02 近期主要科研项目


1. 主持国家自然科学基金青年基金“草鱼miR-142a-3p同步化调控葡萄糖摄入和炎症反应抑制嗜水气单胞菌感染”。

2. 参与大宗淡水鱼产业技术体系项目“青鱼种质资源与育种”。

03 近期发表论文、著作

论文:

1. H. Niu et al., Clustering pattern and evolution characteristic of microRNAs in grass carp (Ctenopharyngodon idella). BMC genomics 24, 73 (2023).

2. Y. Hao et al., Genome-wide association study reveals growth-related SNPs and candidate genes in grass carp (Ctenopharyngodon idella). Aquaculture 577,  (2023).

3. Y. Liu et al., The effects of exposure to microplastics on grass carp (Ctenopharyngodon idella) at the physiological, biochemical, and transcriptomic levels. Chemosphere 286, 131831 (2022).

4. 亚洲草鱼群体的差异甲基化分析. 水产学报,  (2022).

5. Y. He et al., Transcriptomic analysis to elucidate the effects of high stocking density on grass carp (Ctenopharyngodon idella). BMC genomics 22, 620 (2021).

著作:

1. 参编《草鱼种质资源研究》科学出版社201912

04 授权专利

1. 李家乐,张猛,沈玉帮,傅建军,孙俊龙,徐晓雁,党云飞“一种分子辅助选育草鱼优良品系及选育效果验证的方法”. 专利号:201410667437.0. 发明专利。

2. 李家乐,党云飞,张猛,李立森,徐晓雁,沈玉帮,吕利群. “一种便于河道网箱养殖鱼类、贝类的装置”.专利号:201610874257.9. 发明专利

05 主要荣誉、奖项

2023年,入选《水产学报》青年编委,荣获2023年度中国农业期刊优秀审稿专家称号

2019年,荣获上海市“青年东方学者”称号

2019年,获神农中华农业科技一等奖(排名第11

2019年,获中国水产学会范蠡科技进步一等奖(排名第11

2019年,获神农中华农业科技奖优秀创新团队(排名第7

2019年,获上海市科技进步奖二等奖(排名第4