研究方向:生物多样性,分子进化与系统发育,生物信息学

东京工业大学生物科学专业博士，日本学术振兴会研究员，日本国立统计数理研究所 COE 研究员、预测控制研究系助教数据建模研究系特任研究员，兼任日本综合研究大学院大学先导科学研究系生命共生体进化学专业助理。发表学术论文40 余篇，其中 SCI 论文 30 余篇; 审订书籍《听基因讲祖先的故事》;2000 年获井上青年科学家研究奖

01 代表性著作

学术论文：

[1] K. Jin, C. Xue, X. Wu, J. Qian, Y. Zhu, Z. Yang, T. Yonezawa, M. J. C. Crabbe, Y. Cao, M. Hasegawa, Y. Zhong, Y. Zheng (2011) Why Does the Giant Panda Eat bamboo? A Comparative Analysis of Appetite-Reward-Related Genes among Mammals PLoS ONE 6(7): e22602. doi:10.1371/journal.pone.0022602.

[2] Z. Yang, F. Ren, C. Liu, S. He, G. Sun, Q. Gao, L. Yao, Y. Zhang, R. Miao, Y. Zhao, Y. Cao, Y. Zhong and H. Zhao (2010) dbDEMC: a database of differentially expressed miRNAs in human cancers. BMC Genomics 11 (Suppl 4): S5, doi:10.1186/1471-2164-11-S4-S5.

[3] Z. Ren, B. Zhu, E. Ma, J. Wen, T. Tu, Y. Cao, M. Hasegawa, and Y. Zhong (2009) Complete nucleotide sequence and gene arrangement of the mitochondrial genome of the crab-eating frog Fejervarya cancrivora and evolutionary implications. Gene 441:

[4] Y. Zhang, N. Zheng, P. Nan, Y. Cao, M. Hasegawa, Y. Zhong (2007) Computational simulation of interactions between SARS coronavirus spike mutants and host species-specific receptors. Computational Biology and Chemistry 31: 134-137.

[5] T. Sasaki, M. Nikaido, S. Wada, T.K. Yamada, Y. Cao, M. Hasegawa, N. Okada (2006) Balaenoptera omurai is a newly discovered baleen whale that represents an ancient evolutionary lineage. Mol. Phyl. Evol. 41:40-52.

[6] M. Watanabe, M. Nikaido, T.T. Tsuda, T. Kobayashi, D. Mindell, Y. Cao, N. Okada, M. Hasegawa (2006) New candidate species most closely related to penguins. Gene 378: 65-73.

[7] Y. Zhang, N. Zheng, P. Hao, Y. Cao, Y. Zhong Y. (2005) A molecular docking model of SARS-CoV S1 protein in complex with its receptor, human ACE2. Computational Biology and Chemistry 29:254-257.

[8] Z. Li, Q. Liu, M. Song, Y. Zheng, P. Nan, Y. Cao, G. Chen, Y. Li, Y. Zhong (2005) Detecting correlation between sequence and expression divergences in a comparative analysis of human serpin genes. BioSystems 82: 226-234.

[9] T. Sasaki, M. Nikaido, H. Hamilton, M. Goto, H. Kato, N. Kanda, L.A. Pastene, Y. Cao, R.E. Fordyce, M. Hasegawa, N. Okada (2005) Mitochondrial phylogenetics and evolution of Mysticete whales. Syst. Biol. 54(1): 77-90.

[10] M. Nikaido, Y. Cao, N. Okada and M. Hasegawa (2003): The phylogenetic relationships of insectivores with special reference to the lesser hedgehog tenrec as inferred from the complete sequence of their mitochondrial genome, Genes Genet. Syst., 78, 107-112.

书籍：

長谷川政美等著，曹缨、钟扬编(2005):“听基因讲祖先的故事”，上海科技教育出版社

学会发表（口头）：

[1] 曹纓(2018):“海洋生物の系統関係と分岐年代推定”, 生き物文化誌学会研究集会

[2] 曹纓(2017):“脊椎動物の起源における最尤法による系統樹推定”, 日本進化学会

[3] 曹纓(2015):“海洋哺乳動物生物多様性”, プロジェクト研究集会

[4] 曹纓(2012):“極限生物多様性と進化メカニズム”, 新領域融合プロジェクト研究集会

[5] Y. Cao (2010): “Codon-substitution model in analyzing protein-encoding genes for  phylogenetic inference”, International Seminar Workshop on Molecular Biology and Evolution (Shanghai, China)

[6] Y. Cao (2010): “A database of differentially expressed miRNAs in human cancers”, InCoB2010 -- The 9^th International Conference on Bioinformatics (Waseda International Conference Center, Tokyo, Japan)

学术杂志编辑:

統計数理(2018)　第86巻第1号：　特集「分子進化と統計科学」

02 公开讲座、高校、国立大学讲座

[1] 日本国立お茶の水女子大学生命情報学専攻主講“遺伝子データによる生物系統解析方法論”(2013 ～2019)

[2] スーパー・サイエンス・ハイスクール(島根県立益田高校) 主講“他人のそら似”---遺伝子解析で明らかになった進化の謎(2007.12.21)．

[3] 公開講座“分子系統樹推定の理論と実践”主講(2006.1.19－2006.1.20)、(2011.11.17－2011.11.18)；

03 近期主要科研项目

[1] 2010年～2020年

和Department of Biology and Hollings Marine Laboratory, College of Charleston (U.S.A) Andrew Shedlock教授研究室有关“海洋哺乳动物基因组学的比较分析法”展开了共同研究并将其研究结果发表于学术学会

[2] 2004年～2020年

曾多次访问University College of London (U.K.) 杨子恒教授研究室对利用分子数据建立生物系统发育预测模型进行了共同研究并发表多篇共著国际学术论文

[3] 2002年～2017年

与复旦大学生命科学学院钟扬教授有关生物多样性及分子生物信息学进行了长期合作，其研究结果曾多次发表于国际学术杂志，并参加了中国科学院国家高技术研究863功能基因组和生物芯片的项目研究

[4] 2000年～2005年

与中国科学院水生生物研究所王丁研究团队对白暨豚，长江江豚等珍稀水生野生动物的分子进化与系统发育方面进行了合作研究

04 近期荣誉、获奖

井上科学振興財団 第17回井上研究奨励賞